שיטות ניהול מלאי אלו מתמקדות באספקט אחד, באזור ספציפי של ניהול המלאי ולא מנסות לכסות את כל היריעה כפי שקורה במערכת ERP. שיטות ניהול מלאי ממוקדות נושא יכולות להתאים לניהול העבודה מול ספקים באופן מיוחד, לניהול המחסן או לניהול ממוקד של מסחר מוצרים ברשת. שימוש בשיטות אלו מאפשר הפרדת רשויות ולפיכך הן יכולות להיות קלות יותר לשימוש או להטמעה בחברה. כמו כן, מאפשרות שיטות אלו גמישות מרובה בתהליכים המתקיימים בהן, שכן לא הכל מוגדר בהן מראש ואין תלות בין מודול ניהול המלאי לשאר המערכת.
לדוגמא: ניהול מלאי במחסן תרופות בחברה בין לאומית כולל ניהול אצוות ותאריכי תפוגה של תרופות.
שיטת ניהול מלאי מתמקדת במחסן כולל ביצוע איתורים ומשלוח עלונים ודוגמיות לתועמלנים כולל מעקב אחר המשלוח.
המערכת הממוקדת מדוורת התרעות על תפוגה של פריטים לאנשי קשר ומעדכנת אותם על פריטים שנמצאים בקרטינה, כל זאת מבלי להיות תלויים במערכת הכללית.